再生医疗之所以没有普及，是因为注入细胞的手术难度大，也无法充分保证效果。富士胶片控股旗下的Japan Tissue Engineering（J-TEC）自2012年起销售培养软骨，但由于手术难度大，2017财年（截至2018年3月）的销售额仅为约3亿日元（15万个）。

但目前日本很多研究企业大幅简化了手术。今后，治疗费控制在公共保险覆盖的范围之内等或将成为课题。再生医疗实现脏器和组织的再生，不仅是治疗，还可以更换老化衰退的脏器，可以提升生活质量，延长寿命。

细胞品质和安全性的问题。iPS细胞有可能无限增加，因某种契机而形成癌症等肿瘤。针对这种风险，目前仍没有国际性的评估标准。

日本政府对于批准没有前例的治疗极为慎重。作为首例采用iPS细胞的再生医疗，日本理化学研究所对眼部疑难病治疗的临床研究获批时，被要求分析移植用细胞的基因组（全部遗传信息）。预计费用高达数千万日元。

即使观察庞大的分析数据也无法判断风险，而日本政府当初要求研究者做到力所能及的一切事情。从中可以隐隐看出，政府机关希望回避患者发生意外时的责任。很多研究者认为“如果基因组分析成为标准程序将非常麻烦”，这种不安正在成为现实。